古典文学与古代史专业设置在东方学与古代学系，是海德堡大学王牌专业。全德第一，世界第三（2022年QS世界大学学科排名）。该专业学习内容：从最熟悉的古代文学时期学习希腊语和拉丁语，学习古代历史、考古学、艺术、哲学、语言学和语言学元素；学习希腊语翻译、拉丁语翻译、希腊文学、拉丁文学并分别写论文，在历史、哲学、艺术、考古学、语言学中选取两门课程写两篇论文。

神学系是海德堡大学建校之初即设有的四大经典科系之一。神学系：有科学神学专业和实用神学专业，前者包括新约、教堂史、基督教考古学、教职知识、系统神学等课程。此外还有基督教研究室和基督教主祭研究室。在神学院的影响下，1563年出现了著名的海德堡教理问答录。除加尔文主义外，16世纪末出现了后人文主义。在2022年QS世界大学学科排名中，海德堡大学神学排名第22。

海德堡大学考古学在2022年QS世界大学学科排名中，位居第26。考古学专业由东方学与古代学系开设，属于历史学类。该专业主要是培养具有考古学基础和技能，并进一步培养潜力的高级人才，能在考古、文物、博物馆等机构及国家机关从事研究、教学、管理等方面的工作。据买购编辑了解，该专业研究考古植物学、考古测量学、地质考古学、古人类学、考古学和古遗传学、新石器时代考古学或动物考古学中的一个或多个学科。

20世纪90年代以后，海德堡大学通过一系列科研方面的校际交流合作，在医学等学科取得了良好的声誉。医学是海德堡大学最强的专业之一，在2022年QS世界大学学科排名中，海德堡大学医学排名第29。在海德堡大学任教期间获得诺贝尔生理学医学奖的教授有：阿尔布莱希特·考索尔，在蛋白质和核酸研究中取得巨大成果获1910年诺贝尔生理学医学奖。奥托－弗里茨－麦耶豪夫（1922年），伯特·萨克曼（1991年，与厄温·内尔一同），哈拉尔德·楚尔·豪森（2008年）。

海德堡大学生物科学在2022年QS世界大学学科排名中，位列第29。生物科学专业所在的生物科学学院的研究重点是器官和生物体的发育、动植物干细胞的鉴定、细胞内的生化过程和运输过程以及蛋白质的产生和降解等问题。分析包括最高技术水平的形态学、分子学、定量和结构生物学方法。生物科学学院推出了分子生物科学国际硕士/博士课程。所有的教学都是英语。旨在现代生物学研究领域提供全面的集中培训。

物理学专业是海德堡大学最好的专业之一，在2022年QS世界大学学科排名中，海德堡大学物理学和天文学排名第29。据maigoo编辑了解，在海德堡大学任教期间获得诺贝尔物理学奖的教授有：菲力浦·雷纳尔德，因提出电子论和阴极辐射现象荣获1905年诺贝尔物理学奖。瓦尔特·波特，他发展了物理学上的重合方法，发现了电子在光子放射时获得冲量的方法，和宇宙射线中粒子运动以及核反应时核运动的数据，从而获得1954年诺贝尔物理学奖。汉斯·丹尼尔·杰生，因对原子核核层结构的研究而荣获1963年诺贝尔物理学奖。

历史学专业培养了解人类文明一般发展历程和世界历史研究的基本方法，受到史学理论、外国语、史料学、历史地理学、国际政治学、国际经济学、国际关系学及文化人类学等方面的基本训练，能在学术研究、文化教育、外交外贸、国际文化交流、新闻出版及各类企事业单位从事教学、科研和实际工作的历史学高级专门人才。在2022年QS世界大学学科排名中，海德堡大学历史学排名第49。

在2022年QS世界大学学科排名中，海德堡大学体育学排名第51。体育学专业研究体育科学体系及其发展方向。其内容主要是研究体育科学体系的结构、层次及其演变、应设置的学科、各学科之间以及与相关学科之间的相互渗透与综合发展的关系。较早的体育科学体系是随着教育的发展而建立起来的，属于教育范畴的一个科学分支。如今体育学广泛用于健康目的的身体锻炼活动，并发展了相应的理论与学科。

人类学专业从生物和文化的角度对人类进行全面研究，以人作为直接研究对象，并以其为基础和综合理解为目的。该专业旨在培养掌握人类学、社会学、文化学基本理论和方法的德智体全面发展、具有现代科学思想和优良人文素质的专门人才。该专业主要课程有人类学概论、文化人类学理论方法、考古学、体质人类学、世界民族志、宗教学概论、社会学概论等。在2022年QS世界大学学科排名中，海德堡大学人类学排名第51。

海德堡大学地理学在2022年QS世界大学学科排名中，位列第51。地理学专业研究地球表层各圈层相互之间的作用关系，及其空间差异与变化过程的学科体系，包括自然地理学和人文地理学两大部分。地理学传统的研究领域是以自然科学为导向的自然地理学和体现社会和人文科学特点的人类地理学。其主要课程包括地貌学（关于地表形态的知识）、土壤学、水文学、气候学和生物地理学（动物植物地理学）。